Coefficients de régression de Poisson

Modèles Linéaires Généralisés (GLM) en R

Richard Erickson

Instructor

Aperçu du chapitre

  • Décrire les régressions de Poisson
  • Tracer des GLM de Poisson avec ggplot2
  • Décrire la régression logistique avec des odds ratios
  • Tracer des GLM binomiaux avec ggplot2
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Données sur les blessures par incendie

Blessures quotidiennes par incendie à Louisville, KY

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Aperçu des coefficients du modèle linéaire

  • Estimer le nombre quotidien attendu par mois
  • Estimer l'ordonnée à l'origine de référence
  • Estimer l'ordonnée à l'origine des autres mois
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Équation du modèle linéaire

  • $ y \sim \beta_0 + \beta_m x_m + \ldots + \epsilon$
  • $\beta_0$ : ordonnée à l'origine de référence
  • $\beta_m$ : effet du mois $m$
  • $y$ : blessures par jour (p. ex. 1, 0, 4)
  • $x$ : variable muette codant le mois (0 ou 1)
  • $m$ : correspond à l'ordonnée du mois, variable muette
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Résultats du modèle linéaire

  • $\beta_0$ est la valeur attendue (ou moyenne) pour le mois de référence
  • $\beta_m$ est l'effet du mois $m$ (différence vs référence)
  • p. ex., $\beta_0$ + $\beta_m$ = moy. des blessures quotidiennes pour le mois $m$
  • Modèles plus complexes au chapitre 4
  • Les modèles linéaires sont additifs
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Modèle de Poisson

  • $y \sim \text{Poisson}(\lambda)$
  • Lien : $\lambda = e^{(\beta_0 + \beta_m x_m + \epsilon)}$
  • Multiplicatif
  • Exemple de résultats :
    • $\beta_0 \times \beta_1 = \text{ln}(\text{moyenne quotidienne des blessures pour le mois}\ m)$
    • Prendre l'exponentielle pour revenir aux unités brutes
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Différence entre modèles de Poisson et linéaires

  • Modèle de Poisson : $e^{\beta_0 \times \beta_m} = \text{blessures quotidiennes attendues pour le mois}\ m$
  • Modèle linéaire : $\beta_0$ + $\beta_m = \text{blessures quotidiennes attendues pour le mois}\ m$
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Extraction en R

poisson_out <- glm(y ~ x, family = 'poisson')
coef(poisson_out)
exp(coef(poisson_out))
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Solution avec broom

library(broom)
poisson_out <- glm(y ~ x, family = 'poisson')
tidy(poisson_out, exponentiate = TRUE)
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Inférences statistiques

  • Semblable au modèle linéaire à l'échelle du lien
  • Les coefficients diffèrent-ils de zéro ?
  • À l'échelle des données, c'est différent
  • Les coefficients diffèrent-ils de 1 ?
  • Échelle exponentielle plutôt que brute
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Passons à la pratique !

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