Tirer un échantillon bootstrap de chaque échantillon : un tirage aléatoire avec remise dans chacun des échantillons initiaux, de même taille que l'original.

Calculer la statistique bootstrap : par exemple la différence de moyennes, médianes, proportions, etc., à partir des échantillons bootstrap.

Répéter les étapes (1) et (2) de nombreuses fois pour obtenir une distribution bootstrap : la distribution des statistiques bootstrap.

Calculer l'intervalle avec la méthode des percentiles ou celle de l'erreur standard.