Session R = environnement + packages

R pour les utilisateurs de SAS

Melinda Higgins, PhD

Research Professor/Senior Biostatistician Emory University

Pourquoi apprendre R ?

  • Logo R
  • R est GRATUIT. Gratuit au sens coût et au sens licence open source
  • La popularité de R croît rapidement $^1$
    • Les offres en data science pour R dépassent désormais celles pour SAS
    • R est aujourd'hui plus souvent cité dans les articles scientifiques que SAS
  • L'installation de base de R est légère (généralement <100 Mo)
  • Ai‑je mentionné que R est GRATUIT ?
1 [https://r4stats.com/articles/popularity/](https://r4stats.com/articles/popularity/)
R pour les utilisateurs de SAS

Session de calcul : SAS vs R

composants SAS

R pour les utilisateurs de SAS

Session de calcul : SAS vs R

ajouter la bibliothèque de travail SAS

R pour les utilisateurs de SAS

Session de calcul : SAS vs R

packages R

R pour les utilisateurs de SAS

Session de calcul : SAS vs R

ajouter l'environnement global R

R pour les utilisateurs de SAS

Session de calcul : SAS vs R

lien fléché entre composants SAS et packages R

R pour les utilisateurs de SAS

Session de calcul : SAS vs R

lien fléché entre la bibliothèque de travail SAS et l'environnement global R

R pour les utilisateurs de SAS

Données et autres objets

sas proc datasets comme la fonction r ls list

 

  • ls() liste toutes les données et objets associés chargés dans l'environnement global de la session R
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Charger des fichiers de données

sas libname ou data et set comme la fonction r load

 

  • load() charge des jeux de données au format binaire .RData
R pour les utilisateurs de SAS

Environnement global – nouvelle session

En général, aucun objet n'est présent dans l'environnement global au début d'une nouvelle session R.

ls()
character(0)
R pour les utilisateurs de SAS

Charger des données

  • Jeu de données Abalone $^1$
  • Mollusque proche des palourdes, moules ou huîtres
  • Marine Research Lab, Tasmanie, Australie
  • Utiliser les mesures pour prédire l'âge
# Load the abalone dataset
load("abalone.RData")

# List the objects in memory
ls()
"abalone"

photo d'abalone

1 [https://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/abalone](https://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/abalone)
R pour les utilisateurs de SAS

Obtenir de l'aide

menu d'aide SAS comme la fonction r help

 

  • help() donne accès à la documentation de toute fonction ou tout package installé
R pour les utilisateurs de SAS
help(ls)

capture de la page d'aide de la fonction r ls list

R pour les utilisateurs de SAS

Paramètres et fonctionnalités

sas proc setinit et état des produits comme r sessioninfo et library

  • sessioninfo() fournit des détails sur la machine et les packages chargés
  • library() sert à charger des packages pendant votre session R
  • Des dizaines de milliers de packages R sont disponibles, et le nombre augmente chaque jour $^1$
1 [https://cran.r-project.org/web/packages/](https://cran.r-project.org/web/packages/)
R pour les utilisateurs de SAS

R sessionInfo

sessionInfo()
R version 3.4.3 (2017-11-30)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252
[2] LC_CTYPE=English_United States.1252
[3] LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C
[5] LC_TIME=English_United States.1252

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     
R pour les utilisateurs de SAS

R sessionInfo

# Load the dplyr package and run sessionInfo again
library(dplyr)
sessionInfo()
R version 3.4.3 (2017-11-30)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)

... some output removed ...

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base   

other attached base packages:
[1] dplyr_0.7.7
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Commençons votre première session R

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