Interpréter des listes de gènes

ChIP-seq avec Bioconductor en R

Peter Humburg

Statistician, Macquarie University

ChIP-seq avec Bioconductor en R

ChIP-seq avec Bioconductor en R

Identifier des ensembles de gènes enrichis

library(chipenrich)

chipenrich(peaks, genome='hg19', 
           genesets = 'hallmark',
           locusdef = 'nearest_tss')
ChIP-seq avec Bioconductor en R

Passons à la pratique !

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