Normalização de contagens
RNA-Seq com Bioconductor em R
Mary Piper
Bioinformatics Consultant and Trainer
Normalização de contagens
Normalização por profundidade da biblioteca
Efeito da composição da biblioteca
Normalização no DESeq2
Contagens normalizadas: cálculo
dds_wt <- estimateSizeFactors(dds_wt)sizeFactors(dds_wt)
Contagens normalizadas: extração
normalized_wt_counts <- counts(dds_wt, normalized=TRUE)View(normalized_wt_counts)
