O Projeto Bioconductor

Introdução ao Bioconductor em R

James Chapman

Curriculum Manager, DataCamp

Bioconductor

Bioconductor

1 Bioconductor (www.bioconductor.org)
Introdução ao Bioconductor em R

O que medimos e por quê?

  • Estrutura: elementos, regiões, tamanho, ordem, relações

structure-parts

  • Função: expressão, níveis, regulação, fenótipos

function

Introdução ao Bioconductor em R

Como instalar pacotes do Bioconductor?

  • O Bioconductor tem seu próprio repositório e forma de instalar pacotes
# Install BiocManager
install.packages("BiocManager")

# Install the GenomicRanges package
BiocManager::install("GenomicRanges")
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Versão do Bioconductor e versão do pacote

# Load BiocManager
library(BiocManager)


# Check Bioconductor version
version()
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Verificando versões dos pacotes

# Load GenomicRanges
library(GenomicRanges)


# Check versions for reproducibility
sessionInfo()
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Atualizações de pacotes

# Check for package updates
valid()
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Vamos praticar!

Introdução ao Bioconductor em R

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