Aktivität von Zebrafischen und Melatonin

Fallstudien zum statistischen Denken

Justin Bois

Lecturer, Caltech

Fallstudien zum statistischen Denken

Fallstudien zum statistischen Denken

  • Schärfe und erweitere dein statistisches Denken
  • Arbeite mit echten Datensätzen
  • Rückblick: Statistical Thinking in Python (Teil 1) und (Teil 2)
Fallstudien zum statistischen Denken

Aufwärmen mit Zebrafischen

1 Film mit freundlicher Genehmigung von David Prober, Caltech
Fallstudien zum statistischen Denken

Nomenklatur

  • Mutant: Trägt die Mutation auf beiden Chromosomen

  • Wildtyp: Hat die Mutation nicht
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Aktivität von Fischen am Tag und in der Nacht

1 Daten mit freundlicher Genehmigung von Avni Gandhi, Grigorios Oikonomou und David Prober, Caltech
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Aktivphasen: ein Maß für Wachheit

  • Aktivphase: Zeitraum, in dem ein Fisch durchgehend aktiv ist

  • Länge der Aktivphase: Anzahl aufeinanderfolgender Minuten mit Aktivität
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Wahrscheinlichkeitsverteilungen und Geschichten

  • Wahrscheinlichkeitsverteilung: Mathematische Beschreibung von Ergebnissen

  • Eine Wahrscheinlichkeitsverteilung hat eine Geschichte
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Verteilungen aus Statistical Thinking I

  • Gleichverteilung
  • Binomialverteilung
  • Poisson-Verteilung
  • Normalverteilung
  • Exponentialverteilung
Fallstudien zum statistischen Denken

Die Exponentialverteilung

  • Poisson-Prozess: Der Zeitpunkt des nächsten Ereignisses ist völlig unabhängig davon, wann das vorherige stattfand

  • Geschichte der Exponentialverteilung: Die Wartezeit zwischen Ankünften eines Poisson-Prozesses ist exponentialverteilt
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Die Exponential-KVF

x, y = ecdf(nuclear_incident_times)

_ = plt.plot(x, y, marker='.', linestyle='none')

1 Datenquelle: Wheatley, Sovacool und Sornette, Nuclear Events Database
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Die Exponential-KVF

x, y = ecdf(nuclear_incident_times)

_ = plt.plot(x, y, marker='.', linestyle='none')

1 Datenquelle: Wheatley, Sovacool und Sornette, Nuclear Events Database
Fallstudien zum statistischen Denken
 import dc_stat_think as dcst

dcst.pearson_r?
 Signature: dcst.pearson_r(data_1, data_2)
 Docstring: Compute the Pearson correlation coefficient between two 
 samples.
 Parameters
 ----------
 data_1 : array_like
     One-dimensional array of data.
 data_2 : array_like
     One-dimensional array of  data.
 Returns
 -------
 output : float
     The Pearson correlation coefficient between `data_1`
     and `data_2`.
 File:      usr/local/lib/python3.5/site-packages/
            dc_stat_think-0.1.4-py3.6.egg/dc_stat_think/dc_stat_think.py
 Type:      function
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dc_stat_think verwenden

x, y = dcst.ecdf(nuclear_incident_times)

% pip install dc_stat_think
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