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Análise de Imagens Biomédicas em Python

Stephen Bailey

Instructor

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Exemplos de imagens filtradas

Convolução com filtro de nitidez

exemplo de convolução

Convolução com filtro de nitidez

resultado da convolução

Por Michael Plotke - Obra própria, CC BY-SA 3.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=24288958

Convolução de imagem

import imageio.v2 as imageio
import scipy.ndimage as ndi

im=imageio.imread('foot-xray.jpg')

weights = [[.11,  .11, .11],
           [.11,  .12, .11],
           [.11,  .11, .11]]

im_filt = ndi.convolve(im, weights)

fig, axes = plt.subplots(2, 1)
axes[0].imshow(im, cmap='gray')
axes[1].imshow(im_filt,cmap='gray')
plt.imshow()

raio-x do pé suavizado

Funções de filtragem

scipy.ndimage.filters inclui:

median_filter()
uniform_filter()
maximum_filter()
percentile_filter()

ndi.median_filter(im, size=10)

pé - mediana

Filtragem Gaussiana

Distribuição Gaussiana em 1 dimensão Distribuição Gaussiana 1D

ndi.gaussian_filter(im, sigma=5)

Desfoque com sigma = 5

Distribuição Gaussiana em 2 dimensões Por Kghose na Wikipédia em inglês, CC BY-SA 3.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=2550031

ndi.gaussian_filter(im, sigma=10)

Desfoque com sigma = 10

Vamos praticar!

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