Vetores da STL

Otimizando código R com Rcpp

Romain François

Consulting Datactive, ThinkR

Vetores Rcpp vs vetores STL

Vetores do Rcpp

  • Envoltórios leves dos vetores do R
  • Não mudam de tamanho de forma eficiente: cópia de dados a cada vez

Vetores da STL

  • Independentes dos vetores do R
  • Crescem e encolhem com baixo custo: cópias amortizadas
Otimizando código R com Rcpp

Extrair valores positivos de um vetor

Código vetorizado em R

extract_positives <- function(x){
    x[x>0]}

Código ineficiente que cresce um vetor em loop

extract_positives_loop <- function(x){
    y <- numeric()
    for( value in x){
        if( value > 0 ){
            y <- c(x, y)}  }
    y
}
Otimizando código R com Rcpp

Extrair positivos: algoritmo alternativo

  • Primeiro 🔃 para contar o tamanho final
NumericVector x ; 
int n = x.size() ;
int np = 0 ;
for( int i=0 ; i<n ; i++ ){ 
    if( ___ ){
        np++ ;
    }
}
Otimizando código R com Rcpp

Extrair positivos: algoritmo alternativo

  • Crie um vetor do tamanho certo
NumericVector result(np) ;
  • Segundo 🔃 para preencher o vetor
for( int i=0, j=0 ; i<n ; i++ ){
    if( ___ ){
        result[j++] = x[i] ;
    }
}
Otimizando código R com Rcpp

Algoritmo mais simples usando a STL

// [[Rcpp::export]]
std::vector<double> positives_stl( NumericVector x ){
    std::vector<double> out ;
    out.reserve( x.size() / 2 ) ;

    for( ___ ; ___ ; ___ ){
        if( ___ ){
            out.push_back(___) ;
        }
    }

    return out ;  
}
Otimizando código R com Rcpp

Vamos praticar!

Otimizando código R com Rcpp

Preparing Video For Download...