Poisson regresyonunu görselleştirme

R'de Genelleştirilmiş Doğrusal Modeller

Richard Erickson

Instructor

Poisson ile geom_smooth ne zaman kullanılır

Sürekli yordayıcılarla en iyi çalışır
Örn., doz artışı ve cm$^2$ başına kanser hücresi sayısı
Aksi halde kutu grafiği vb. kullanın

Kanser hücresi doz çalışması

Veri simüle edin
Doz-yanıt
- x: Doz
- y: cm$^2$ başına kanser hücresi sayısı

Noktaları çizin

ggplot(data = dat, aes(x = dose, y = cells)) +
    geom_point()

Noktalı ggplot

Jitter uygulayın

ggplot(data = dat, aes(x = dose, y = cells)) +
   geom_jitter(width = 0.05, height = 0.05)

ggplot2 ile jitter uygulanmış noktalar örneği.

geom_smooth()

ggplot(data = dat, aes(x = dose, y = cells)) +
   geom_jitter(width = 0.05, height = 0.05)
   geom_smooth()

Jitterlı noktalar üzerinde varsayılan geom_smooth() örneği

geom_smooth() ile GLM’ler

ggplot(data = dat, aes(x = dose, y = cells)) +
   geom_jitter(width = 0.05, height = 0.05)
   geom_smooth(method = 'glm')

Varsayılan GLM ile geom_smooth() örneği, bir doğrusal model (LM)

geom_smooth() ile Poisson GLM

ggplot(data = dat, aes(x = dose, y = cells)) +
   geom_jitter(width = 0.05, height = 0.05) +
   geom_smooth(method = 'glm', method.args = list(family = 'poisson'))

Poisson regresyon grafiği örneği

Adımların özeti

Çakışmayan noktalar çizin
Poisson eğilim çizgisi ekleyin
Grafiği düzenleyin (burada yapılmadı)

Hadi pratik yapalım!

R'de Genelleştirilmiş Doğrusal Modeller