R'de ggplot2 ile görselleştirme

SAS Kullananlar İçin R

Melinda Higgins, PhD

Research Professor/Senior Biostatistician Emory University

ggplot2 paketi

ggplot2 heksetiketi logosu

ggplot2, R için güçlü bir grafik paketidir
ggplot'taki "GG", "grafik dilbilgisi"ni ifade eder
ggplot2, grafikleri katmanlayarak oluşturur
Bir veya daha fazla geometrik nesne temel katmana eklenir

Katmanlar - temel katman

# Create plot for x=sex and y=diameter
ggplot(data = abalone, aes(sex, diameter))

Temel katmanı ggplot() ile tanımla
data = abalone ayarla
aes'i sex ve diameter olarak ayarla
Grafikte henüz görsel nesne yok
x ekseni sex için hazır
y ekseni diameter için hazır
ızgara yerleşti

ggplot2 grafik ortamı, henüz kutu grafiği yok

Katmanlar - kutu grafik geom ekle

# Add boxplot geometric object or geom
ggplot(data = abalone,
       aes(sex, diameter)) +
  geom_boxplot()

+ operatörü katman ekler
Kutu grafiği geom_boxplot() eklendi
Sonuç bir dizi kutu grafiği
Cinsiyete göre abalone çapları
F dişi, I yavru, M erkek

ggplot2 kutu grafikleri eklendi

Katmanlar - tema ekle

# Add black white theme
ggplot(data = abalone,
       aes(sex, diameter)) +
  geom_boxplot() +
  theme_bw()

theme_bw() ile "tema" katmanı ekle
Gri arka planı kaldırır
Grafiğin etrafına siyah kutu çizer

ggplot2 kutu grafik siyah-beyaz tema eklendi

Kutu grafiği geom'unu keman geom'a çevir

# Change to geom_violin()
ggplot(data = abalone,
       aes(sex, diameter)) +
  geom_violin() +
  theme_bw()

geom_violin, geom_boxplot'ın yerini alır
Keman benzeri bir şekil oluşturur
Veri yoğunluğu dağılımını yansıtır
Küçük bir değişiklikle yeni şekil

ggplot2 keman grafiği

Tek değişkenli histogram

# Make histogram of shuckedWeight
ggplot(abalone, aes(shuckedWeight)) +
  geom_histogram()

Tek değişken için histogram oluştur
Tek değişken = tek estetik
geom_histogram() ekle
aes()'i shuckedWeight olarak ayarla
Varsayılan renkler değişmeli

ggplot2 histogram tamamı siyah

Histogram - renklendir

# Make lines black and fill light blue
ggplot(abalone, aes(shuckedWeight)) +
  geom_histogram(color = "black",
                 fill = "lightblue")

Grafik parametrelerini değiştir
Bin çizgilerinin colorını ayarla
Sütunların fill rengini ayarla
Her seçenek () içinde verilir
Histogram çok daha iyi görünüyor

ggplot2 histogram mavi sütunlar ve siyah kenarlar

Histogram - başlık ve eksen etiketleri ekle

# Add x, y axis labels and title
ggplot(abalone, aes(shuckedWeight)) +
  geom_histogram(color = "black",
                 fill = "lightblue") +
  xlab("Shucked Weight") +
  ylab("Frequency Counts") +
  ggtitle("Shucked Weights Histogram")

Eksenler ve başlık için daha iyi etiketler ekle
Eksenler için xlab() ve ylab() kullan
Başlık için ggtitle() kullan
Bu şekil yayına hazır!

ggplot2 histogram eksen etiketleri ve başlık eklendi

Saçılım grafiği oluştur

# Make scatterplot with geom_point()
ggplot(abalone,
       aes(rings, shellWeight)) +
  geom_point()

Saçılım grafiği aes iki değişken ister
geom_point() noktaları ekler
Halkaya göre kabuk ağırlıkları saçılımı

ggplot2 saçılım grafiği: rings'e göre shellWeight

Saçılım grafiğine düzgünleştirilmiş çizgi ekle

# Add smoothed fit line
ggplot(abalone,
       aes(rings, shellWeight)) +
  geom_point() +
  geom_smooth()

Saçılım grafiğine geom_smooth() çizgisi ekle
Gölgelendirilmiş güven aralığı içerir

ggplot2 saçılım grafiğine düzgünleştirilmiş uyum çizgisi eklendi

Başka bir değişkene göre paneller oluştur

# Add panels using facet_wrap()
ggplot(abalone,
       aes(rings, shellWeight)) +
  geom_point() +
  geom_smooth() +
  facet_wrap(vars(sex))

Saçılım grafiğine bir katman daha ekle
Her abalone cinsiyeti için paneller oluştur
facet_wrap() katmanını ekle
Panellerin değişkenini vars(sex) tanımlar

ggplot2 saçılım grafiği, cinsiyete göre 3 panel

Kursun geri kalanı

Bölüm 1, grafiklere kısa bir girişle biter
- ggplot2 grafik becerileri temeli
- abalone ölçümlerini cinsiyete göre görselleştir
Bölüm 2 veri düzenleme becerilerini öğretir
- abalone veri kümesini temizle
Bölüm 3 veri keşfi yöntemlerini öğretir
- betimsel istatistikler, korelasyonlar ve karşılaştırma testleri
Bölüm 4 modelleme ve sonuç sunumunu öğretir
- ölçümlerle abalone yaşlarını tahmin et
- cinsiyete göre modelleri incele

Hadi abalones için birkaç grafik yapalım

SAS Kullananlar İçin R