STL'den Vektörler

Rcpp ile R Kodunu Optimize Etme

Romain François

Consulting Datactive, ThinkR

Rcpp vektörleri vs STL vektörleri

Rcpp vektörleri

R vektörlerinin ince sarmalayıcıları
Boyutu (maliyet etkin şekilde) değiştiremez: her seferinde veri kopyası

STL vektörleri

R vektörlerinden bağımsız
Büyütme/küçültme ucuz: amorti edilmiş kopyalar

Bir vektörden pozitif değerleri çıkar

Vektörleştirilmiş R kodu

extract_positives <- function(x){
    x[x>0]}

Bir döngüde vektörü büyüten verimsiz kod

extract_positives_loop <- function(x){
    y <- numeric()
    for( value in x){
        if( value > 0 ){
            y <- c(x, y)}  }
    y
}

Pozitif değerleri çıkar: alternatif algoritma

Önce nihai boyutu say 🔃

NumericVector x ; 
int n = x.size() ;
int np = 0 ;
for( int i=0 ; i<n ; i++ ){ 
    if( ___ ){
        np++ ;
    }
}

Pozitif değerleri çıkar: alternatif algoritma

Doğru boyutta bir vektör oluştur

NumericVector result(np) ;

Sonra vektörü doldur 🔃

for( int i=0, j=0 ; i<n ; i++ ){
    if( ___ ){
        result[j++] = x[i] ;
    }
}

STL kullanarak daha basit algoritma

// [[Rcpp::export]]
std::vector<double> positives_stl( NumericVector x ){
    std::vector<double> out ;
    out.reserve( x.size() / 2 ) ;

    for( ___ ; ___ ; ___ ){
        if( ___ ){
            out.push_back(___) ;
        }
    }

    return out ;  
}

Hadi pratik yapalım!

Rcpp ile R Kodunu Optimize Etme