Casestudy deel II: Visualisatie

Introductie tot netwerkanalyse in Python

Eric Ma

Data Carpentry instructor and author of nxviz package

nxviz-API

import networkx as nx
import nxviz as nv
G = nx.erdos_renyi_graph(n=20, p=0.3)

circ = nv.circos(G, node_color_by='key', sort_by='key')

Een graaf met twee componenten: knopen binnen elke component zijn onderling verbonden, maar de componenten zijn niet met elkaar verbonden.

import networkx as nx
G = nx.erdos_renyi_graph(n=100, p=0.03)

nx.connected_components(G)

<generator object connected_component_subgraphs at 0x10cb2c990>

list(nx.connected_components(G))

[<networkx.classes.graph.Graph at 0x10ca24588>,
 <networkx.classes.graph.Graph at 0x10ca244e0>]

for g in list(nx.connected_components(G)):
    print(len(g.nodes()))

99
1

Introductie tot netwerkanalyse in Python