Kenmerkdetectie

Biomedische beeldanalyse met Python

Stephen Bailey

Instructor

Randen: scherpe intensiteitswissels

Kernel voor randdetectie

im=imageio.imread('foot-xray.jpg')

weights = [[+1, +1, +1],
           [ 0,  0,  0],
           [-1, -1, -1]]

edges = ndi.convolve(im, weights)

plt.imshow(edges, cmap='seismic')

voet-randen

Sobel-filters

sobel-horizontaal

sobel-verticaal

Sobel-filters

ndi.sobel(im, axis=0)

randen-horizontaal

ndi.sobel(im, axis=1)

randen-verticaal

Sobel-filtergrootte

Combineer horizontale en verticale randen door de afstand te nemen:

$$z = \sqrt{x^2 + y^2}$$

edges0=ndi.sobel(im, axis=0)
edges1=ndi.sobel(im, axis=1)

edges=np.sqrt(np.square(edges0) + 
              np.square(edges1))

plt.imshow(edges, cmap='gray')

gecombineerde-randen

Laten we oefenen!

Biomedische beeldanalyse met Python