Replicatie en blokkeren

Experimenteel ontwerp in R

Joanne Xiong

Data Scientist

Replicatie

Herhaal een experiment om variatie goed te meten
Test je een geneesmiddel maar bij één persoon, dan kun je niet generaliseren (kan niet!)

library(dplyr)
mtcars %>%
    count(cyl)

    cyl  n
1   4     11
2   6      7
3   8     14

Blokkeren

Maakt groepen meer vergelijkbaar en dempt variatie
Binnen groepen: kleine verschillen. Tussen groepen: grotere verschillen
Voorbeeld: groepen blokkeren op geslacht

Boxplots

# Boxplot of MPG by Car Cylinders
ggplot(mtcars, aes(x=as.factor(cyl), 
                   y=mpg)) + 
  geom_boxplot(fill="slateblue", 
               alpha=0.2) + 
  xlab("cyl")

alternatieve tekst

Functies voor modelleren

Lineaire modellen
```
lm(formula, data, na.action,...)
```
One-way ANOVA-model
```
aov(formula, data = NULL, ...)
```
Genest ANOVA-model
```
anova(object,...)
```

Laten we oefenen!

Experimenteel ontwerp in R