Concept van projectie

Gemiddelde netwerkanalyse in Python

Eric Ma

Data Carpentry instructor and author of nxviz package

Projectie

Unipartite weergave van bipartite connecties
- Geconditioneerd op de verbindingen met de knopen in de andere partitie

Projectie

Unipartite weergave van bipartite connecties

ch2-1.006.png

Projectie

Unipartite weergave van bipartite connecties

ch2-1.007.png

Projectie

Unipartite weergave van bipartite connecties

ch2-1.008.png

Projectie

Unipartite weergave van bipartite connecties

ch2-1.009.png

Grafen op schijf

Platte edgelists
CSV's: nodelist + metadata, edgelist + metadata

Netwerkdata inlezen

import networkx as nx
G = nx.read_edgelist('american-revolution.txt')

list(G.edges(data=True))[0:5]

[('Parkman.Elias', 'LondonEnemies', {'weight': 1}),
 ('Parkman.Elias', 'NorthCaucus', {'weight': 1}),
 ('Inglish.Alexander', 'StAndrewsLodge', {'weight': 1}),
 ('NorthCaucus', 'Chadwell.Mr', {'weight': 1}),
 ('NorthCaucus', 'Pearce.IsaacJun', {'weight': 1})]

Tekstbestand

Barrett.Samuel LondonEnemies {'weight': 1}
Barrett.Samuel StAndrewsLodge {'weight': 1}
Marshall.Thomas LondonEnemies {'weight': 1}
Eaton.Joseph TeaParty {'weight': 1}
Bass.Henry LondonEnemies {'weight': 1}

Bipartite projectie

list(G.nodes())

['product2', 'customer3', 'customer1', 'product3',  
    'customer2', 'product1']

list(G.edges())

[('product2', 'customer1'),
 ('product2', 'customer2'),
 ('customer3', ‘product1')]

Bipartite projectie

cust_nodes = [n for n in G.nodes() if G.nodes[n]
                  ['bipartite'] == 'customers']
cust_nodes

['customer3', 'customer1', 'customer2']

Bipartite projectie

G_cust = nx.bipartite.projected_graph(G, cust_nodes)
list(G_cust.nodes())

['customer1', 'customer3', 'customer2']

list(G_cust.edges())

[('customer1', 'customer2')]

Graadcentraliteit

Herinner de definitie van graadcentraliteit $$\frac{\text{aantal buren}}{\text{aantal mogelijke buren}}$$
Noemer: aantal knopen in de tegenoverliggende partitie

Bipartite graadcentraliteit

nx.bipartite.degree_centrality(G, cust_nodes)

{'customer1': 0.3333333333333333,
 'customer2': 0.3333333333333333,
 'customer3': 0.3333333333333333,
 'product1': 0.3333333333333333,
 'product2': 0.6666666666666666,
 'product3': 0.0}

Bipartite graadcentraliteit

nx.degree_centrality(G)

{'customer1': 0.2,
 'customer2': 0.2,
 'customer3': 0.2,
 'product1': 0.2,
 'product2': 0.4,
 'product3': 0.0}

Laten we oefenen!

Gemiddelde netwerkanalyse in Python