Packages en namespaces

Defensief programmeren in R

Dr. Colin Gillespie

Jumping Rivers

Je globale omgeving

De standaardomgeving is .GlobalEnv
Objecten staan in omgevingen
Bekijk de inhoud met ls()
Deze omgeving zit snel vol
Dan gaan we objecten door elkaar halen

n
# of bedoelde ik
N

Packages en omgevingen

Packages gebruiken namespaces als naamruimtes
- Zie een namespace als een doos met de package erin
Een namespace houdt dingen netjes
- Zoals mappen

Geëxporteerde functies

library() geeft je directe toegang tot die packagedoos
library("dplyr") geeft directe toegang tot de geëxporteerde functies in dplyr

## 238 exported functions
getNamespaceExports("dplyr")

Of gebruik :: om een functie direct aan te roepen

## De filter-functie uit dplyr
dplyr::filter

Great minds think alike

Soms hebben packages dezelfde functienaam

## De functie filter()
stats::filter()
dplyr::filter()

Als ik filter() typ, welke krijg ik dan?
Dat hangt af van de laadvollgorde!

Great minds think alike

search() helpt je hierbij

search()

# [1] ".GlobalEnv"         "package:dplyr"      "package:stats"  
# <Other packages>

Wees defensief

Namespace-conflicten zijn meer dan vervelend

Ze kunnen tot lastig te vinden bugs leiden

De conflicted-package maakt je functiekeuze expliciet

library("conflicted")
library("dplyr")

filter

#Error: [conflicted] `filter` found in 2 packages.
#Either pick the one you want with `::` 
# * dplyr::filter
# * stats::filter
#Or declare a preference with `conflict_prefer()`
# * conflict_prefer("filter", "dplyr")
# * conflict_prefer("filter", "stats")

Tijd om wakker te worden

Defensief programmeren in R