Plot tingkat lanjut

Analisis Citra Biomedis dengan Python

Stephen Bailey

Instructor

Untuk memplot data N-dimensi, irislah!

roti utuh

roti iris

Memplot banyak gambar sekaligus

plt.subplots: membuat kanvas figur dengan beberapa objek AxesSubplots.

Plot kanvas figur

import imageio.v2 as imageio
vol = imageio.volread('chest-data', format='DICOM')
fig, axes = plt.subplots(nrows=1,
                         ncols=3)

axes[0].imshow(vol[0],cmap='gray')

axes[1].imshow(vol[10],cmap='gray')
axes[2].imshow(vol[20],cmap='gray')

for ax in axes:
    ax.axis('off')

plt.show()

Memplot banyak gambar sekaligus

subplot serangkaian citra volume dada

Tampilan non-standar

import imageio.v2 as imageio

vol = imageio.volread(
      'chest-data', format='DICOM')

view_1v2 = vol[pln, :, :]
view_1v2 = vol[pln]

$$Aksial$$

tampilan-aksial

Tampilan non-standar

import imageio.v2 as imageio

vol = imageio.volread(
     'chest-data', format='DICOM')

view_1v2 = vol[pln, :, :]
view_1v2 = vol[pln]

view_0v2 = vol[:, row, :]

$$Koronal$$

tampilan-koronal

Tampilan non-standar

import imageio.v2 as imageio

vol = imageio.volread(
     'chest-data', format='DICOM')

view_1v2 = vol[pln, :, :]
view_1v2 = vol[pln]

view_0v2 = vol[:, row, :]

view_0v1 = vol[:, :, col]

$$Sagital$$

tampilan-sagital

Mengubah rasio aspek

Piksel bisa memiliki rasio aspek apa pun:

rasio-aspek

im = vol[:,:,100]
d0, d1, d2 = vol.meta['sampling']
d0, d1, d2

(2, 0.5, 0.5)

asp = d0 / d1
asp

plt.imshow(im, cmap='gray',
           aspect=asp)
plt.show()

Mengubah rasio aspek

iris sagital

Ayo berlatih!

Analisis Citra Biomedis dengan Python