Interpreting Gene Lists

ChIP-seq dengan Bioconductor di R

Peter Humburg

Statistician, Macquarie University

ChIP-seq dengan Bioconductor di R

ChIP-seq dengan Bioconductor di R

Finding enriched gene sets

library(chipenrich)

chipenrich(peaks, genome='hg19', 
           genesets = 'hallmark',
           locusdef = 'nearest_tss')
ChIP-seq dengan Bioconductor di R

Let's practice!

ChIP-seq dengan Bioconductor di R

Preparing Video For Download...