Uji hipotesis

Studi Kasus dalam Pemikiran Statistik

Justin Bois

Lecturer, Caltech

Dampak mutasi terhadap aktivitas

1 Data courtesy of Avni Gandhi, Grigogios Oikonomou, dan David Prober, Caltech
Studi Kasus dalam Pemikiran Statistik

Definisi genotipe

  • Wild type: Tanpa mutasi

  • Heterozigot: Mutasi pada salah satu dari dua kromosom

  • Mutan: Mutasi pada kedua kromosom
Studi Kasus dalam Pemikiran Statistik

Dampak mutasi terhadap aktivitas

1 Data courtesy of Avni Gandhi, Grigogios Oikonomou, dan David Prober, Caltech
Studi Kasus dalam Pemikiran Statistik

Dampak mutasi terhadap aktivitas

1 Data courtesy of Avni Gandhi, Grigogios Oikonomou, dan David Prober, Caltech
Studi Kasus dalam Pemikiran Statistik

Uji hipotesis

Penilaian seberapa masuk akal data yang diamati dengan asumsi suatu hipotesis benar

Studi Kasus dalam Pemikiran Statistik

p-value

Peluang memperoleh nilai statistik uji yang setidaknya sebesar atau lebih ekstrem dari yang diamati, dengan asumsi hipotesis nol benar

Studi Kasus dalam Pemikiran Statistik

Statistik uji

  • Satu angka yang dihitung dari data teramati dan dari data yang Anda simulasikan di bawah hipotesis nol

  • Menjadi dasar perbandingan
Studi Kasus dalam Pemikiran Statistik

p-value

Peluang memperoleh nilai statistik uji yang setidaknya sebesar atau lebih ekstrem dari yang diamati, dengan asumsi hipotesis nol benar

Memerlukan spesifikasi jelas tentang:

  • Hipotesis nol yang dapat disimulasikan
  • Statistik uji yang dapat dihitung dari data teramati dan tersimulasikan
  • Definisi setidaknya sebesar atau lebih ekstrem dari
Studi Kasus dalam Pemikiran Statistik

Alur uji hipotesis

  • Nyatakan hipotesis nol dengan jelas
  • Definisikan statistik uji Anda
  • Hasilkan banyak set data simulasi dengan asumsi hipotesis nol benar
  • Hitung statistik uji untuk tiap himpunan data simulasi
  • p-value adalah fraksi himpunan data simulasi dengan statistik uji setidaknya sebesar atau lebih ekstrem dari data nyata
Studi Kasus dalam Pemikiran Statistik

Menetapkan uji

Hipotesis nol: panjang active bout ikan wild type dan heterozigot berdistribusi identik

Statistik uji: Selisih rata-rata panjang active bout antara heterozigot dan wild type

Setidaknya sebesar atau lebih ekstrem dari: Statistik uji lebih besar atau sama dengan yang diamati

Studi Kasus dalam Pemikiran Statistik

Uji permutasi

Untuk tiap replikasi:

  • Acak label titik data
  • Hitung statistik uji
perm_reps = dcst.draw_perm_reps(
    data_a, data_b, dcst.diff_of_means, size=10000
)

p-value adalah fraksi replikasi yang setidaknya sebesar atau lebih ekstrem dari yang diamati

p_val = np.sum(perm_reps >= diff_means_obs) / len(perm_reps)
Studi Kasus dalam Pemikiran Statistik

Ayo berlatih!

Studi Kasus dalam Pemikiran Statistik

Preparing Video For Download...