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Analisi di immagini biomediche in Python

Stephen Bailey

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Esempi di immagini filtrate

Convoluzione con un filtro di nitidezza

esempio-di-convoluzione

Convoluzione con un filtro di nitidezza

risultato-della-convoluzione

Di Michael Plotke - Opera propria, CC BY-SA 3.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=24288958

Convoluzione di immagini

import imageio.v2 as imageio
import scipy.ndimage as ndi

im=imageio.imread('foot-xray.jpg')

weights = [[.11,  .11, .11],
           [.11,  .12, .11],
           [.11,  .11, .11]]

im_filt = ndi.convolve(im, weights)

fig, axes = plt.subplots(2, 1)
axes[0].imshow(im, cmap='gray')
axes[1].imshow(im_filt,cmap='gray')
plt.imshow()

radiografia-del-piede-levigata

Funzioni di filtraggio

scipy.ndimage.filters include:

median_filter()
uniform_filter()
maximum_filter()
percentile_filter()

ndi.median_filter(im, size=10)

piede-mediana

Filtraggio gaussiano

Distribuzione gaussiana in 1 dimensione Distribuzione gaussiana 1D

ndi.gaussian_filter(im, sigma=5)

Sfocatura con sigma = 5

Distribuzione gaussiana in 2 dimensioni Di Kghose alla Wikipedia in inglese, CC BY-SA 3.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=2550031

ndi.gaussian_filter(im, sigma=10)

Sfocatura con sigma = 10

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