Impostare e visualizzare le chiavi di data.table
Unire i dati con data.table in R
Scott Ritchie
Postdoctoral Researcher in Systems Genomics
Impostare le chiavi di `data.table`
Impostare le chiavi evita di usare l'argomento on nei join
- Utile se devi usare una
data.tablein molti join diversi
Ordina in memoria la data.table per le colonne chiave
- Rende più veloci filtraggio e join
Puoi impostare e usare più colonne come chiavi
La funzione `setkey()`
Le colonne chiave si passano come argomenti
setkey(DT, ...)
setkey(DT, key1, key2, key3)setkey(DT, "key1", "key2", "key3")
# Per impostare tutte le colonne di DT come chiavi
setkey(DT)
La funzione `setkey()`
Imposta le chiavi di entrambe le data.table prima di un join
setkey(dt1, dt1_key)
setkey(dt2, dt2_key)
Esegui un inner, right e left join:
# Inner join tra dt1 e dt2 dt1[dt2, nomatch = 0]# Right join tra dt1 e dt2 dt1[dt2]# Left join tra dt1 e dt2 dt2[dt1]
Impostare le chiavi in modo programmatico
Le colonne chiave sono fornite come vettore di caratteri
keys <- c("key1", "key2", "key3")
setkeyv(dt, keys)
Recuperare le chiavi
haskey() verifica se hai impostato le chiavi
haskey(dt1)
TRUE
key() restituisce le colonne chiave impostate
key(dt1)
"dt1_key"
Recuperare le chiavi
Quando non sono impostate chiavi
haskey(dt_no_key)
FALSE
key(dt_no_key)
NULL
Visualizzare tutte le `data.table` e le loro chiavi
tables()
NAME NROW NCOL MB COLS KEY
[1,] dt 3 4 1 key1,key2,key3,value key1,key2,key3
[2,] dt1 1,000 3 1 dt1_key_column,value,group dt1_key
[3,] dt2 1,000 2 1 dt2_key_column,time dt2_key
[4,] dt_no_key 5 2 1 id,color
Total: 4MB
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