Biểu diễn dữ liệu mạng với pandas

Phân tích mạng nâng cao với Python

Eric Ma

Data Carpentry instructor and author of nxviz package

Tệp CSV để lưu trữ dữ liệu mạng

Tệp CSV

person,party,weight
Barrett.Samuel,LondonEnemies,1
Barrett.Samuel,StAndrewsLodge,1
Marshall.Thomas,LondonEnemies,1
Eaton.Joseph,TeaParty,1
Bass.Henry,LondonEnemies,1

Tệp CSV để lưu trữ dữ liệu mạng

Ưu điểm:
- Dễ đọc với người dùng
- Phân tích thêm bằng pandas
Nhược điểm:
- Lặp lại; tốn dung lượng
Hai DataFrame: danh sách nút và cạnh

Danh sách nút và cạnh

Danh sách nút
- Mỗi hàng là một nút
- Các cột là metadata gắn với nút
Danh sách cạnh
- Mỗi hàng là một cạnh
- Các cột là metadata gắn với cạnh

Pandas và đồ thị

list(G.nodes(data=True))

[(0, {'bipartite': 0}),
(1, {'bipartite': 0}),
(2, {'bipartite': 0}),
...]

nodelist = []

for n, d in G.nodes(data=True):
    node_data = dict() 
    node_data['node'] = n

    node_data.update(d)

    nodelist.append(node_data)

Pandas và đồ thị

nodelist

[{'bipartite': 0, 'node': 0},
{'bipartite': 0, 'node': 1},
{'bipartite': 0, 'node': 2},
{'bipartite': 0, 'node': 3},
{'bipartite': 0, 'node': 4},...]

Pandas và đồ thị

import pandas as pd
pd.DataFrame(nodelist)

  bipartite  node
0           0     0
1           0     1
2           0     2
3           0     3
4           0     4
5           1     5
6           1     6
7           1     7

pd.DataFrame(nodelist).to_csv('my_file.csv')

Ayo berlatih!

Phân tích mạng nâng cao với Python