Ôn tập ChIP-seq

ChIP-seq với Bioconductor trong R

Peter Humburg

Statistician, Macquarie University

Ôn tập: Nhập dữ liệu

Nạp peak calls

peaks <- import.bed(peak_file, genome="hg19")

Tạo đối tượng BamViews

bam_views <- BamViews(bam_file, bamRanges=peaks)

Nạp reads

reads <- readGAlignments(bam_views)
ChIP-seq với Bioconductor trong R

Ôn tập: Trực quan hóa dữ liệu ChIP-seq

ChIP-seq với Bioconductor trong R

ChIP-seq với Bioconductor trong R

Ôn tập: So sánh liên kết khác biệt

ChIP-seq với Bioconductor trong R

Ôn tập: Phân tích làm giàu

ChIP-seq với Bioconductor trong R

Tiến bước

ChIP-seq với Bioconductor trong R

Làm tốt lắm!

ChIP-seq với Bioconductor trong R

Preparing Video For Download...