Các lựa chọn thay thế boxplot

Thực hành tốt nhất về trực quan hóa trong R

Nick Strayer

Instructor

Giới hạn của boxplot kèm jitter

• Jitter “thông minh” chỉ xử lý được chồng lấn ở mức độ nhất định
• Khó nhận biết mật độ dữ liệu

Có những lựa chọn nào khác?

Biểu đồ beeswarm

Biểu đồ violin

Biểu đồ beeswarm

• Jitter “thông minh”
• Gom các điểm sát trục nhất có thể
• Có sẵn geom_beeswarm() trong gói ggbeeswarm.

library(ggbeeswarm)
ggplot(data, aes(y = y, x =  group)) + 
  geom_beeswarm(color = 'steelblue')

Ưu điểm của beeswarm

• Điểm dữ liệu riêng lẻ
• Hình dạng phân phối

Nhược điểm của beeswarm

• Khó đọc khi có nhiều dữ liệu
• Xếp chồng tùy tiện

Biểu đồ violin

• KDE phản chiếu để đối xứng
• Chỉ cần thay geom_boxplot() bằng geom_violin().

ggplot(data, aes(y = y, x = group)) + 
  geom_violin(fill = 'steelblue') 

Ưu điểm của violin

• Mọi điểm dữ liệu đều được “nghe thấy”
• Không phải điểm nào cũng “thấy” được, phù hợp khi dữ liệu lớn.

Nhược điểm của violin

• Chọn độ rộng kernel
• Không thấy được từng điểm dữ liệu

Hãy thử các so sánh nâng cao hơn!

Thực hành tốt nhất về trực quan hóa trong R