Tóm tắt phân tích biểu hiện khác biệt RNA-Seq

RNA-Seq với Bioconductor trong R

Mary Piper

Bioinformatics Consultant and Trainer

quy trình làm việc

RNA-Seq với Bioconductor trong R

Chuẩn bị RNA-Seq

RNA-Seq với Bioconductor trong R

QC

RNA-Seq với Bioconductor trong R

Quy trình RNA-Seq: Kiểm soát chất lượng dữ liệu thô

Nhiễm bẩn trình tự

RNA-Seq với Bioconductor trong R

Căn chỉnh

RNA-Seq với Bioconductor trong R

Quy trình RNA-Seq: Căn chỉnh

Căn chỉnh 2

RNA-Seq với Bioconductor trong R

Định lượng

RNA-Seq với Bioconductor trong R

Quy trình RNA-Seq: Định lượng

counts

RNA-Seq với Bioconductor trong R

Quy trình đầy đủ

RNA-Seq với Bioconductor trong R

Chuẩn bị cho phân tích biểu hiện khác biệt: đối tượng DESeq2

dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData = rawcounts,
                        colData = metadata,
                        design = ~ condition)

dữ liệu counts

RNA-Seq với Bioconductor trong R

Cùng luyện tập nào!

RNA-Seq với Bioconductor trong R

Preparing Video For Download...