차등 발현 분석

R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq

Mary Piper

Bioinformatics Consultant and Trainer

DESeq2

R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq

차등 발현 분석: DESeq2 비네트

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DESeq2 비네트

R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq

비네트 탐색

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DESeq2 워크플로

R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq

DESeq2 데이터 불러오기

# Read in raw counts
wt_rawcounts <- read.csv("fibrosis_wt_rawcounts.csv") 
View(wt_rawcounts)

섬유증 wt 카운트

R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq

DESeq2 데이터 불러오기: 메타데이터

# Read in metadata
wt_metadata <- read.csv("fibrosis_wt_metadata_unordered.csv") 
View(wt_metadata)

섬유증 wt 메타데이터

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연습해 봅시다!

R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq

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