RNA-Seq DE 분석 요약

R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq

Mary Piper

Bioinformatics Consultant and Trainer

워크플로

R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq

RNA-Seq 준비

R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq

품질 관리

R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq

RNA-Seq 워크플로: 원시 데이터 품질 관리

염기서열 오염

R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq

정렬

R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq

RNA-Seq 워크플로: 정렬

정렬2

R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq

정량화

R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq

RNA-Seq 워크플로: 정량화

카운트

R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq

전체 워크플로

R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq

차등 발현 분석 준비: DESeq2 객체

dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData = rawcounts,
                        colData = metadata,
                        design = ~ condition)

카운트 데이터

R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq

연습해 봅시다!

R로 하는 Bioconductor 기반 RNA-Seq

Preparing Video For Download...