이미지 비교

Python을 활용한 생의학 영상 분석

Stephen Bailey

Instructor

이미지 비교

두 이미지와 겹친 이미지

요약 지표

목표: 두 이미지 간 유사도 지표 정의

비용 함수: 최소화할 지표를 생성합니다.

목적 함수: 최대화할 지표를 생성합니다.

평균 절대 오차

import imageio.v2 as imageio
import numpy as np
i1=imageio.imread('OAS1035-v1.dcm')
i2=imageio.imread('OAS1035-v2.dcm')

err = i1 - i2

plt.imshow(err)

마스크 오차

abs_err = np.abs(err)
plt.imshow(abs_err)

mae = np.mean(abs_err)
mae

29.8570

마스크 절대 오차

평균 절대 오차

목표: 비용 함수 최소화

# Improve im1 alignment to im2
xfm=ndi.shift(im1, shift=(-8, -8))
xfm=ndi.rotate(xfm, -18,
                 reshape=False)

# Calculate cost
abs_err = np.abs(im1 - im2)
mean_abs_err = np.mean(abs_err)

mean_abs_err

13.0376

조정된 오버레이

합집합의 교집합

$$ IOU = \frac{I_1 \cap I_2 }{I_1 \cup I_2}$$

mask1 = im1 > 0
mask2 = im2 > 0

intsxn = mask1 & mask2
plt.imshow(intsxn)

마스크 교집합

union = mask1 | mask2
plt.imshow(union)

iou = intsxn.sum() / union.sum()
iou

0.68392

마스크 합집합

연습해 봅시다!

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