마스크

Python을 활용한 생의학 영상 분석

Stephen Bailey

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전체 뇌

이미지 마스크

마스크

마스크 생성

논리 연산은 각 픽셀에서 True / False를 반환합니다

mat = np.array([[1, 2, 3],
                [4, 5, 6],
                [7, 8, 9]])

mat > 5

np.array([[False, False, False],
          [False, False, True ],
          [True,  True,  True ]])

주요 연산

hist=ndi.histogram(im, 0, 255, 256)

mask1 = im > 32

발 히스토그램

발 마스크 1

mask2 = im > 64

mask3 = mask1 & ~mask2

발 마스크 2

발 마스크 1과 2

np.where(condition, x, y) 마스크를 통과할 데이터를 제어합니다.

import numpy as np

im_bone = np.where(im > 64, im, 0)

plt.imshow(im_bone, cmap='gray')
plt.axis('off')
plt.show()

비골격 영역이 제거된 이미지

m = np.where(im > 64, 1, 0)

발 마스크 1

ndi.binary_dilation(m,iterations=5)

발 마스크 이진 팽창

ndi.binary_erosion(m,iterations=5)

발 마스크 이진 침식

Python을 활용한 생의학 영상 분석