차등 발현 분석

R에서 limma로 하는 차등 발현 분석

John Blischak

Instructor

차등 발현 분석의 목표는 무엇인가?

• 관심 표현형과 연관된 유전자 식별
• 예시:
  • 약물 등 자극에 대한 반응
  • 발달 과정에서의 변화
  • 유전적 돌연변이의 영향

왜 차등 발현인가?

• 새로운 발견

  • 추가적인 관심 유전자가 존재하는가?

• 맥락

  • 특정 유전자의 측정값이 고유한가, 아니면 일반적인가?

• 시스템

  • 어떤 생물학적 경로가 중요한가?

실험 완료를 위한 여러 단계

• 연구 설계
• 실험 수행
• 데이터 수집
• 데이터 전처리
• 데이터 탐색
• 데이터 검정
• 결과 해석
• 결과 공유

주의 사항

• 측정값은 절대값이 아닌 상대값

• 통계적 방법으로 잘못 설계된 연구를 보완할 수 없음

연습해 봅시다!

R에서 limma로 하는 차등 발현 분석