ChIP-seq 복습

R에서 Bioconductor로 배우는 ChIP-seq

Peter Humburg

Statistician, Macquarie University

복습: 데이터 가져오기

피크 호출 불러오기

peaks <- import.bed(peak_file, genome="hg19")

BamViews 객체 생성

bam_views <- BamViews(bam_file, bamRanges=peaks)

리드 불러오기

reads <- readGAlignments(bam_views)
R에서 Bioconductor로 배우는 ChIP-seq

복습: ChIP-seq 데이터 시각화

R에서 Bioconductor로 배우는 ChIP-seq

R에서 Bioconductor로 배우는 ChIP-seq

복습: 차등 결합

R에서 Bioconductor로 배우는 ChIP-seq

복습: 농축 분석

R에서 Bioconductor로 배우는 ChIP-seq

앞으로 나아가기

R에서 Bioconductor로 배우는 ChIP-seq

잘 하셨습니다!

R에서 Bioconductor로 배우는 ChIP-seq

Preparing Video For Download...