HDF5ファイルのインポート

Python でのデータインポート入門

Hugo Bowne-Anderson

Data Scientist at DataCamp

HDF5ファイル

  • Hierarchical Data Format version 5（階層型データ形式バージョン5）
  • 数値データを大量に保存するための標準形式
  • データセットは数百ギガバイト〜テラバイトに及ぶことがある
  • HDF5はエクサバイト規模まで拡張可能
Python でのデータインポート入門

HDF5ファイルのインポート

import h5py
filename = 'H-H1_LOSC_4_V1-815411200-4096.hdf5'
data = h5py.File(filename, 'r') # 'r' is to read
print(type(data))

<class 'h5py._hl.files.File'>
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HDF5ファイルの構造

for key in data.keys():
    print(key)

meta
quality
strain

print(type(data['meta']))

<class 'h5py._hl.group.Group'>

ch_2_3.014.png

Python でのデータインポート入門

HDF5ファイルの構造

for key in data['meta'].keys():
    print(key)

Description
DescriptionURL
Detector
Duration
GPSstart
Observatory
Type
UTCstart

print(np.array(data['meta']['Description']), np.array(data['meta']['Detector']))

b'Strain data time series from LIGO' b'H1'
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HDFプロジェクト

  • HDF グループによって保守される

ch_2_3.019.png

  • イリノイ州シャンペーン拠点
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