差次的発現解析
RNA-Seq with Bioconductor in R
Mary Piper
Bioinformatics Consultant and Trainer
差次的発現解析：DESeq2ビネット
vignette(DESeq2)
DESeq2へのデータ読み込み
# Read in raw counts
wt_rawcounts <- read.csv("fibrosis_wt_rawcounts.csv")
View(wt_rawcounts)
DESeq2へのデータ読み込み：メタデータ
# Read in metadata
wt_metadata <- read.csv("fibrosis_wt_metadata_unordered.csv")
View(wt_metadata)
