ケーススタディ II：可視化

Pythonで学ぶネットワーク分析入門

Eric Ma

Data Carpentry instructor and author of nxviz package

nxviz の API

import networkx as nx
import nxviz as nv
G = nx.erdos_renyi_graph(n=20, p=0.3)

circ = nv.circos(G, node_color_by='key', sort_by='key')

2つの部分グラフからなるグラフ。各部分グラフ内ではノード同士が接続されているが、部分グラフ同士は接続されていない。

import networkx as nx
G = nx.erdos_renyi_graph(n=100, p=0.03)

nx.connected_components(G)

<generator object connected_component_subgraphs at 0x10cb2c990>

list(nx.connected_components(G))

[<networkx.classes.graph.Graph at 0x10ca24588>,
 <networkx.classes.graph.Graph at 0x10ca244e0>]

for g in list(nx.connected_components(G)):
    print(len(g.nodes()))

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