フィルタ

Python による生体医療画像解析

Stephen Bailey

Instructor

フィルタ

フィルタ適用画像の例

シャープ化フィルタによる畳み込み

畳み込みの例

シャープ化フィルタによる畳み込み

畳み込みの結果

By Michael Plotke - Own work, CC BY-SA 3.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=24288958

画像の畳み込み

import imageio.v2 as imageio
import scipy.ndimage as ndi

im=imageio.imread('foot-xray.jpg')

weights = [[.11,  .11, .11],
           [.11,  .12, .11],
           [.11,  .11, .11]]

im_filt = ndi.convolve(im, weights)

fig, axes = plt.subplots(2, 1)
axes[0].imshow(im, cmap='gray')
axes[1].imshow(im_filt,cmap='gray')
plt.imshow()

平滑化された足のX線画像

フィルタリング関数

scipy.ndimage.filters に含まれる関数:

median_filter()
uniform_filter()
maximum_filter()
percentile_filter()

ndi.median_filter(im, size=10)

足のメディアンフィルタ適用結果

ガウシアンフィルタリング

1次元のガウス分布 1次元ガウス分布

ndi.gaussian_filter(im, sigma=5)

sigma = 5 でのぼかし

2次元のガウス分布 By Kghose at the English language Wikipedia, CC BY-SA 3.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=2550031

ndi.gaussian_filter(im, sigma=10)

sigma = 10 でのぼかし

練習しましょう！

Python による生体医療画像解析