Bioconductorプロジェクト

Rで始めるBioconductor入門

James Chapman

Curriculum Manager, DataCamp

Bioconductor

Bioconductor

1 Bioconductor (www.bioconductor.org)
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何を、なぜ測定するのか？

  • 構造：要素、領域、サイズ、順序、関係性

structure-parts

  • 機能：発現、レベル、制御、表現型

function

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Bioconductorパッケージのインストール方法

  • Bioconductorには独自のリポジトリとパッケージインストール方法があります
# Install BiocManager
install.packages("BiocManager")

# Install the GenomicRanges package
BiocManager::install("GenomicRanges")
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Bioconductorとパッケージのバージョン

# Load BiocManager
library(BiocManager)


# Check Bioconductor version
version()
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パッケージバージョンの確認

# Load GenomicRanges
library(GenomicRanges)


# Check versions for reproducibility
sessionInfo()
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パッケージの更新

# Check for package updates
valid()
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練習しましょう！

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