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R で学ぶ data.table によるデータ結合

Scott Ritchie

Postdoctoral Researcher in Systems Genomics

data.tableの結合

2つのdata.tableの情報を1つのdata.tableに結合する

コース概要

第1章：merge() を使ったデータの結合
第2章：data.table ワークフローでの結合
第3章：結合のトラブルシューティング
第4章：data.table の連結と変形

テーブルキー

2つのテーブル間で情報を結びつける列

library(data.table)

demographics <- data.table(name   = c("Trey", "Matthew", "Angela"), 
                           gender = c(NA, "M", "F"), 
                           age    = c(54, 43, 39))

shipping <- data.table(name    = c("Matthew", "Trey", "Angela"), 
                       address = c("7 Mill road", "12 High street", 
                                   "33 Pacific boulevard"))

Rセッションで `data.table` を確認する

tables() 関数は、Rセッションに読み込まれた全ての data.table を表示します

tables()

           NAME NROW NCOL MB            COLS KEY
1: demographics    3    3  0 name,gender,age    
2:     shipping    3    2  0    name,address    
Total: 0MB

Rセッションで `data.table` を確認する

str() は単一の data.table の各列の型を表示します

str(demographics)

Classes 'data.table' and 'data.frame':    3 obs. of  3 variables:
 $ name  : chr  "Trey" "Matthew" "Angela"
 $ gender: chr  NA "M" "F"
 $ age   : num  54 43 39
 - attr(*, ".internal.selfref")=<externalptr>

Rセッションで `data.table` を確認する

demographics_all

         name sex age
  1:     Trey  NA  54
  2:  Matthew   M  43
  3:   Angela   F  39
  4: Michelle   F  63
  5:  Mohamed   M  26
 ---                 
102:  Patrick   M  27
103:      Wei   F  41
104:     Adam   M  33
105:  Somchai   M  53
106:     Alma   F  19

練習しましょう！

R で学ぶ data.table によるデータ結合