data.tableキーの設定と確認
R で学ぶ data.table によるデータ結合
Scott Ritchie
Postdoctoral Researcher in Systems Genomics
`data.table`キーの設定
キーを設定すると、結合時にon引数が不要になります
- 同じ
data.tableを多くの結合で使用する場合に便利です
メモリ上のdata.tableをキー列でソートします
- フィルタリングや結合の処理が高速化されます
複数の列をキーとして設定・使用できます
`setkey()`関数
キー列を引数として渡します
setkey(DT, ...)
setkey(DT, key1, key2, key3)setkey(DT, "key1", "key2", "key3")
# To set all columns in DT as keys
setkey(DT)
`setkey()`関数
結合前に両方のdata.tableのキーを設定します
setkey(dt1, dt1_key)
setkey(dt2, dt2_key)
内部結合・右結合・左結合の実行:
# Inner join dt1 and dt2 dt1[dt2, nomatch = 0]# Right join dt1 and dt2 dt1[dt2]# Left join dt1 and dt2 dt2[dt1]
プログラムによるキーの設定
キー列を文字ベクトルで指定します
keys <- c("key1", "key2", "key3")
setkeyv(dt, keys)
キーの取得
haskey()でキーが設定されているか確認します
haskey(dt1)
TRUE
key()で設定済みのキー列を返します
key(dt1)
"dt1_key"
キーの取得
キーが設定されていない場合
haskey(dt_no_key)
FALSE
key(dt_no_key)
NULL
すべての`data.table`とキーの確認
tables()
NAME NROW NCOL MB COLS KEY
[1,] dt 3 4 1 key1,key2,key3,value key1,key2,key3
[2,] dt1 1,000 3 1 dt1_key_column,value,group dt1_key
[3,] dt2 1,000 2 1 dt2_key_column,time dt2_key
[4,] dt_no_key 5 2 1 id,color
Total: 4MB
練習しましょう！
R で学ぶ data.table によるデータ結合
