箱ひげ図の代替

R による可視化ベストプラクティス

Nick Strayer

Instructor

箱ひげ図＋ジッターの限界

• ジッターでは重なりに限界がある
• 密度感がつかみにくい

他の選択肢は？

ビー群プロット

バイオリンプロット

ビー群プロット

• スマートなジッター
• 個々の点を軸近くにできるだけ密集配置
• ggbeeswarm の geom_beeswarm() で簡単に利用可能

library(ggbeeswarm)
ggplot(data, aes(y = y, x =  group)) + 
  geom_beeswarm(color = 'steelblue')

ビー群プロットの利点

• 個々のデータ点
• 分布の形状

ビー群プロットの欠点

• データが多いと見づらい
• 積み上げが恣意的になりうる

バイオリンプロット

• KDE を左右対称に反映
• geom_boxplot() を geom_violin() に置き換えるだけ

ggplot(data, aes(y = y, x = group)) + 
  geom_violin(fill = 'steelblue') 

バイオリンの利点

• すべてのデータ点を反映
• すべては見えないため大量データに適する

バイオリンの欠点

• カーネル幅の選択が影響
• すべての点は可視化されない

より高度な比較に進みましょう！

R による可視化ベストプラクティス