t-分布確率的近傍埋め込み（t-SNE）

Rによる次元削減

Matt Pickard

Owner, Pickard Predictives, LLC

t-SNE と PCA の比較表

PCA と t-SNE の可視化

PCA

PCA プロット

大域構造を保持

t-SNE

t-SNE プロット

局所構造を保持（近傍点を近くに保つ）

t-SNE のハイパーパラメータ

Perplexity - 参照する最近傍点数を決める
Learning rate - ニューラルネットの重み更新の速さ
Iterations - 逆伝播の反復回数

t-SNE

t-SNE プロット

R での t-SNE

library(Rtsne)


set.seed(1234)
tsne <- Rtsne(attrition_df %>% select(-Attrition))


tsne_df <- attrition_df %>% 
  bind_cols(tsne_x = tsne$Y[,1], tsne_y = tsne$Y[,2])


tsne_df %>% 
  ggplot(aes(x = tsne_x, y = tsne_y, color = Attrition)) +
  geom_point(alpha = 0.5)

t-SNE プロット

Let's practice!

Rによる次元削減