ロジスティックGAMの可視化
Rで学ぶGeneralized Additive Models (GAMs) による非線形モデリング
Noam Ross
Senior Research Scientist, EcoHealth Alliance
スケールの変換
対数オッズプロット
plot(binom_mod)
偏効果の変換
plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis)
偏効果の変換 (2)
plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis)
切片の追加
plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
shift = coef(binom_mod)[1])
切片の追加 (2)
plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
shift = coef(binom_mod)[1])
切片の不確実性の組み込み
plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
shift = coef(binom_mod)[1],
seWithMean = TRUE)
プロットの改善
plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis, shift = coef(binom_mod)[1],
seWithMean = TRUE, rug = FALSE, shade = TRUE,
shade.col = "lightgreen", col = "purple")
