Jak najdu úzké místo?

Efektivní kód v R

Colin Gillespie

Jumping Rivers & Newcastle University

Profilování kódu

Obecná myšlenka spočívá v:

Spuštění kódu
Záznamu aktuálně prováděné operace každých několik milisekund
Rprof() je součástí R a dělá přesně toto
- Složité použití
Místo toho použijte profvis

Datová sada IMDB

Z balíčku ggplot2movies

data(movies, package = "ggplot2movies")
dim(movies)

58788    24

Datový rámec: přibližně 60 000 řádků a 24 sloupců
Každý řádek odpovídá jednomu filmu

Statečné srdce

braveheart = movies[7288,]

Rok	Délka	Hodnocení
1995	177	8.3

Příklad: Statečné srdce

# Load data
data(movies,
     package = "ggplot2movies")
braveheart <- movies[7288,]
movies <- movies[movies$Action==1,]

plot(movies$year, movies$rating,
     xlab = "Year", ylab = "Rating")

# local regression line
model <- loess(rating ~ year,
               data = movies)
j <- order(movies$year)
lines(movies$year[j],
      model$fitted[j],
      col = "forestgreen")

points(braveheart$year,
       braveheart$rating,
       pch = 21,
       bg = "steelblue")

Profvis

RStudio má integrovanou podporu profilování pomocí profvis
- Označte kód, který chcete profilovat
- Profile -> Profile Selected lines

Příkazová řádka

library("profvis")

profvis({

data(movies, package = "ggplot2movies") # Load data
braveheart <- movies[7288,]
movies <- movies[movies$Action == 1,]
plot(movies$year, movies$rating, xlab = "Year", ylab="Rating")
model <- loess(rating ~ year, data = movies) # loess regression line
j <- order(movies$year)
lines(movies$year[j], model$fitted[j], col="forestgreen", lwd=2)
points(braveheart$year, braveheart$rating,
     pch = 21, bg = "steelblue", cex = 3)

})

Který řádek bude podle vás nejpomalejší?

Pojďme procvičovat!

Efektivní kód v R