Základní funkce lm() s glm()

Zobecněné lineární modely v R

Richard Erickson

Instructor

Práce s objekty modelu

Práce s výstupy modelu
Funkce Base R fungují s glm()
Užitečné zkratky

Výpis modelu

print() je obvykle výchozí

print(poisson_out)

Call:  glm(formula = y ~ x, family = "poisson", data = dat)

Coefficients:
(Intercept)            x  
   -1.43036      0.05815  

Degrees of Freedom: 29 Total (i.e. Null);  28 Residual
Null Deviance:        35.63 
Residual Deviance: 30.92     AIC: 66.02

Souhrn modelu

summary() poskytuje více podrobností

summary(poisson_out)

#...
Deviance Residuals: 
    Min       1Q   Median       3Q      Max  
-1.6547  -0.9666  -0.7226   0.3830   2.3022

Coefficients:
            Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)  
(Intercept) -1.43036    0.59004  -2.424   0.0153 *
x            0.05815    0.02779   2.093   0.0364 *

Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

(Dispersion parameter for poisson family taken to be 1)

    Null deviance: 35.627  on 29  degrees of freedom
Residual deviance: 30.918  on 28  degrees of freedom
AIC: 66.024

Number of Fisher Scoring iterations: 5

Přehledný výstup

Tidyverse poskytuje standardizované výstupy modelu
tidy() z balíčku Broom

library(broom)
tidy(poisson_out)

         term    estimate  std.error statistic    p.value
1 (Intercept) -1.43035579 0.59003923 -2.424171 0.01534339
2           x  0.05814858 0.02778801  2.092578 0.03638686

Regresní koeficienty

coef() zobrazí regresní koeficienty

coef(poisson_out)

(Intercept)           x 
-1.43035579  0.05814858

Intervaly spolehlivosti

confint() odhaduje intervaly spolehlivosti

confint(poisson_out)

Waiting for profiling to be done...
               2.5 %     97.5 %
(Intercept) -2.725545344 -0.3897748
x            0.005500767  0.1155564

Predikce

predict(model, new_data)
Argument new_data:
- Nezadán: predict() vrací predikce na základě původních dat.
- Zadán: predict() vrací predikce pro new_data.

Dataset zranění při požárech

Denní zranění civilistů
Louisville, KY
Počtová data, mnoho nul

Denní zranění při požárech v Louisville, KY

Pojďme si procvičit!

Zobecněné lineární modely v R