Replikace a blokování

Experimental Design in R

Joanne Xiong

Data Scientist

Replikace

Pro správné posouzení variability je nutné experiment opakovat
Pokud provedeme experiment s léčivem pouze na jedné osobě, jak lze výsledky zobecnit? (Nelze!)

library(dplyr)
mtcars %>%
    count(cyl)

    cyl  n
1   4     11
2   6      7
3   8     14

Blokování

Pomáhá kontrolovat variabilitu tím, že skupiny léčby jsou si podobnější
Uvnitř skupin jsou rozdíly minimální, mezi skupinami větší
Příkladem je blokování skupin léčby podle pohlaví

Krabicové grafy

# Boxplot of MPG by Car Cylinders
ggplot(mtcars, aes(x=as.factor(cyl), 
                   y=mpg)) + 
  geom_boxplot(fill="slateblue", 
               alpha=0.2) + 
  xlab("cyl")

alternativní text

Funkce pro modelování

Lineární modely
```
lm(formula, data, na.action,...)
```
Jednofaktorový model ANOVA
```
aov(formula, data = NULL, ...)
```
Vnořený model ANOVA
```
anova(object,...)
```

Pojďme si procvičit!

Experimental Design in R