Analýza diferenciální exprese

RNA-Seq s Bioconductorem v R

Mary Piper

Bioinformatics Consultant and Trainer

DESeq2

RNA-Seq s Bioconductorem v R

Analýza diferenciální exprese: vignette DESeq2

vignette(DESeq2)

vignette DESeq2

RNA-Seq s Bioconductorem v R

průzkum vignette

RNA-Seq s Bioconductorem v R

pracovní postup DESeq2

RNA-Seq s Bioconductorem v R

Načtení dat pro DESeq2

# Read in raw counts
wt_rawcounts <- read.csv("fibrosis_wt_rawcounts.csv") 
View(wt_rawcounts)

počty fibrózy wt

RNA-Seq s Bioconductorem v R

Načtení dat pro DESeq2: metadata

# Read in metadata
wt_metadata <- read.csv("fibrosis_wt_metadata_unordered.csv") 
View(wt_metadata)

metadata fibrózy wt

RNA-Seq s Bioconductorem v R

Vamos praticar!

RNA-Seq s Bioconductorem v R

Preparing Video For Download...