Vizualizace logistických GAM

Nelineární modelování s generalizovanými aditivními modely (GAM) v R

Noam Ross

Senior Research Scientist, EcoHealth Alliance

Transformace škál

Grafy log-šancí

plot(binom_mod)

Převod parciálních efektů

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis)

Převod parciálních efektů (2)

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis)

Přidání interceptu

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1])

Přidání interceptu (2)

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1])

Zahrnutí nejistoty interceptu

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1],
     seWithMean = TRUE)

Vylepšení grafu

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis, shift = coef(binom_mod)[1],
     seWithMean = TRUE, rug = FALSE, shade = TRUE, 
     shade.col = "lightgreen", col = "purple")

Pojďme si procvičit!

Nelineární modelování s generalizovanými aditivními modely (GAM) v R