Nastavení a zobrazení klíčů data.table

Joining Data with data.table in R

Scott Ritchie

Postdoctoral Researcher in Systems Genomics

Nastavení klíčů `data.table`

Nastavení klíčů umožňuje vynechat argument on při spojování

  • Užitečné, pokud je data.table použita v mnoha různých spojeních

Seřadí data.table v paměti podle klíčového sloupce (sloupců)

  • Urychluje filtrování a operace spojování

Jako klíče lze nastavit více sloupců

Joining Data with data.table in R

Funkce `setkey()`

Klíčové sloupce se předávají jako argumenty

setkey(DT, ...)
setkey(DT, key1, key2, key3)

setkey(DT, "key1", "key2", "key3")
# To set all columns in DT as keys
setkey(DT)
Joining Data with data.table in R

Funkce `setkey()`

Nastavte klíče obou data.tables před spojením

setkey(dt1, dt1_key)
setkey(dt2, dt2_key)

Proveďte vnitřní, pravé a levé spojení:

# Inner join dt1 and dt2
dt1[dt2, nomatch = 0] 

# Right join dt1 and dt2 dt1[dt2]
# Left join dt1 and dt2 dt2[dt1]
Joining Data with data.table in R

Programové nastavení klíčů

Klíčové sloupce jsou zadány jako znakový vektor

keys <- c("key1", "key2", "key3")
setkeyv(dt, keys)
Joining Data with data.table in R

Získání klíčů

haskey() ověří, zda jsou klíče nastaveny

haskey(dt1)
TRUE

key() vrátí nastavené klíčové sloupce

key(dt1)
"dt1_key"
Joining Data with data.table in R

Získání klíčů

Pokud nejsou nastaveny žádné klíče

haskey(dt_no_key)
FALSE
key(dt_no_key)
NULL
Joining Data with data.table in R

Zobrazení všech `data.tables` a jejich klíčů

tables()
     NAME        NROW NCOL MB COLS                       KEY           
[1,] dt             3    4  1 key1,key2,key3,value       key1,key2,key3
[2,] dt1        1,000    3  1 dt1_key_column,value,group dt1_key
[3,] dt2        1,000    2  1 dt2_key_column,time        dt2_key
[4,] dt_no_key      5    2  1 id,color                                 
Total: 4MB
Joining Data with data.table in R

Pojďme si procvičit!

Joining Data with data.table in R

Preparing Video For Download...