Joining Data with data.table in R
Scott Ritchie
Postdoctoral Researcher in Systems Genomics
Nastavení klíčů umožňuje vynechat argument on při spojování
data.table použita v mnoha různých spojeníchSeřadí data.table v paměti podle klíčového sloupce (sloupců)
Jako klíče lze nastavit více sloupců
Klíčové sloupce se předávají jako argumenty
setkey(DT, ...)
setkey(DT, key1, key2, key3)setkey(DT, "key1", "key2", "key3")
# To set all columns in DT as keys
setkey(DT)
Nastavte klíče obou data.tables před spojením
setkey(dt1, dt1_key)
setkey(dt2, dt2_key)
Proveďte vnitřní, pravé a levé spojení:
# Inner join dt1 and dt2 dt1[dt2, nomatch = 0]# Right join dt1 and dt2 dt1[dt2]# Left join dt1 and dt2 dt2[dt1]
Klíčové sloupce jsou zadány jako znakový vektor
keys <- c("key1", "key2", "key3")
setkeyv(dt, keys)
haskey() ověří, zda jsou klíče nastaveny
haskey(dt1)
TRUE
key() vrátí nastavené klíčové sloupce
key(dt1)
"dt1_key"
Pokud nejsou nastaveny žádné klíče
haskey(dt_no_key)
FALSE
key(dt_no_key)
NULL
tables()
NAME NROW NCOL MB COLS KEY
[1,] dt 3 4 1 key1,key2,key3,value key1,key2,key3
[2,] dt1 1,000 3 1 dt1_key_column,value,group dt1_key
[3,] dt2 1,000 2 1 dt2_key_column,time dt2_key
[4,] dt_no_key 5 2 1 id,color
Total: 4MB
Joining Data with data.table in R