Reference vs. kopie

Škálovatelné zpracování dat v R

Simon Urbanek

Member of R-Core, Lead Inventive Scientist, AT&T Labs Research

Velké matice a matice – podobnosti

  • Indexování
  • Přiřazení
Škálovatelné zpracování dat v R

Velké matice a matice – rozdíly

  • big.matrix je uložena na disku
  • Přetrvává mezi relacemi R
  • Lze sdílet mezi relacemi R
Škálovatelné zpracování dat v R

R obvykle vytváří kopie při přiřazení

Vytvoří kopii a a přiřadí ji do b.

a <- 42
b <- a
a
42
b
42
a <- 43
a
43
b
42
Škálovatelné zpracování dat v R

R obvykle vytváří kopie při přiřazení

a <- 42

foo <- function(a){a <- 43 paste("Inside the function a is", a)}
foo(a)
"Inside the function a is 43"
paste("Outside the function a is still", a)
"Outside the function a is still 42"
Škálovatelné zpracování dat v R

Ne všechny objekty R se kopírují

Tato funkce změní hodnotu a v globálním prostředí

foo <- function(a) {a$val <- 43 
                    paste("Inside the function a is", a$val)}
a <- environment()
a$val <- 42
foo(a)
"Inside the function a is 43"
paste("Outside the function a$val is", a$val)
"Outside the function a$val is 43"
Škálovatelné zpracování dat v R

deepcopy()

# x is a big matrix
x <- big.matrix(...)

# x_no_copy and x refer to the same object
x_no_copy <- x

# x_copy and x refer to different objects
x_copy <- deepcopy(x)

Škálovatelné zpracování dat v R

Chování reference

R nevytváří kopie implicitně

  • Minimalizuje využití paměti
  • Zkracuje dobu provádění
Škálovatelné zpracování dat v R

Ne všechny objekty R se kopírují

library(bigmemory)

x <- big.matrix(nrow = 1, ncol = 3, type = "double", 
                init = 0, 
                backingfile = "hello-bigmemory.bin", 
                descriptorfile = "hello-bigmemory.desc")
Škálovatelné zpracování dat v R

Ne všechny objekty R se kopírují

x_no_copy <- x
x[,]
0 0 0
x_no_copy[,]
0 0 0
x[,] <- 1
x[,]
1 1 1
x_no_copy[,]
1 1 1
Škálovatelné zpracování dat v R

Ne všechny objekty R se kopírují

x_copy <- deepcopy(x)
x[,]
1 1 1
x_copy[,]
1 1 1
x[,] <- 2
x[,]
2 2 2
x_copy[,]
1 1 1
Škálovatelné zpracování dat v R

Pojďme procvičovat!

Škálovatelné zpracování dat v R

Preparing Video For Download...