Porównywanie więcej niż dwóch obserwacji

Analiza skupień w R

Dmitriy Gorenshteyn

Lead Data Scientist, Memorial Sloan Kettering Cancer Center

Najbliższa obserwacja do pary

	1	2	3
2	11.7
3	16.8	18.0
4	10.0	20.6	15.8

• Czy 2 jest najbliżej grupy 1,4?
• Czy 3 jest najbliżej grupy 1,4?

Kryteria wiązania: pełne

	1	2	3
2	11.7
3	16.8	18.0
4	10.0	20.6	15.8

• Czy 2 jest najbliżej grupy 1,4?
  • max(D(2,1), D(2,4)) = 20.6
• Czy 3 jest najbliżej grupy 1,4?
  • max(D(3,1), D(3,4)) = 16.8

Grupowanie hierarchiczne

Wiązanie pełne: maksymalna odległość między zbiorami

Grupowanie z użyciem wiązania i odległości

Grupowanie z użyciem wiązania i odległości

Grupowanie z użyciem wiązania i odległości

Grupowanie z użyciem wiązania i odległości

Grupowanie z użyciem wiązania i odległości

Grupowanie z użyciem wiązania i odległości

Grupowanie z użyciem wiązania i odległości

Grupowanie z użyciem wiązania i odległości

Grupowanie z użyciem wiązania i odległości

Grupowanie z użyciem wiązania i odległości

Kryteria wiązania

Wiązanie pełne: maksymalna odległość między zbiorami

Wiązanie pojedyncze: minimalna odległość między zbiorami

Wiązanie średnie: średnia odległość między zbiorami

Czas na ćwiczenia!

Analiza skupień w R